Anne Whitney nació en  Watertown, Massachusetts en el año 1821, hija de un terrateniente llamado Nathaniel Whitney y Sarah Stone Whitney. Eran una familia acomodada lo cual le permitió a los padres sustentar una educación artística de su hija. Una temprana educación liberal introdujo en Anne ideas abolicionistas, así como sus creencias sobre la igualdad de las mujeres. De todas maneras, el hecho de ser mujer, le impidió asistir a universidad como Yale o Harvard, así que tuvo que recibir la clásica instrucción mediante tutores. Asistió a una selecta escuela de Maine, y luego abrió su propio instituto en Salem, Massachusetts. Durante ese tiempo también comenzó a escribir poemas, teniendo un relativo suceso con los mismos, siendo publicada en un par de revistas: Harper y Atlantic Monthly. Sus colección de poemas fue publicada en 1859.

Siendo una mujer artista, en una esfera dominada por los hombres, Anne misma, experimento en propia carne, lo que era luchar por la igualdad. En 1875, habiendo sido escultora por alrededor de unos veintes años, entró en una competencia nacional para realizar la escultura del luchador abolicionista Clark Summer. Whitney ganó dicha competencia, pero la realización del trabajo le fue negada, cuando se constató que Whitney era una mujer. Tras eso se negó a lo largo de su vida a participar en ninguna competencia. 

Sobre su obra, su primera trabajo de escultura fue un busto de una joven niña Laura Brown (1859; National Museum of American Art, Smithsonian Institution). También realizó esculturas de su familia, así como de la pintora Abby Adeline Manning, con la cual se dice que Whitney tuvo un matrimonio bostoniano.

Vivió un tiempo en Boston, donde se hizo amiga de Harriet Hosmer y su vecina Mary Edmonia Lewis. Del mismo modo en que lo hicieron Hosmer y Lewis, Whitney viajó a Roma como una forma de expandir sus habilidades. Años más tarde el escritor Henry James apodó a Hosmer, Whitney, Lewis, y Emma Stebbins todas artistas lesbianas junto al grupo de artistas no lesbianas integrado por Luisa Lander, Margaret Foley, Florence Freeman, y Vinnie Ream Hoxie: "that strange sisterhood of American 'lady sculptors' who at one time settled upon the seven hills [of Rome] in a white, marmorean flock," eso referido a sus preferencias por el mármol blanco. 

En su regreso a EEUU Whitney recibió la comisión para hacer una escultura de Samuel Adams para el Capitolio, dicha escultura fue expuesta en Boston, y tuvo tanto éxito que se hizo una copia para Boston, en bronce que aún está en Adams Square en el frente del Faneuil Hall. Realizó asímismo una escultura de Lucy Stone, una amiga y feminista, eso a pesar de sus protestas contra la segregación de las mujeres en el arte. Lucy Stone fue la primer mujer en Massachusetts que obtuvo título secundario, y mantuvo su nombre a pesar de casarse, inspirando a otras feministas en el futuro a llamarse a sí mismas "Lucy Stoners."

Anne falleció el 23 de Enero de 1915.